本季延续前作风格，康熙与宜妃、三德子、法印再次微服出巡。表面上是查办江南盐税案，实则是为了引蛇出洞，揪出朝中与地方勾结的“八爷党”。途中，康熙结识了正直的年轻书生，却发现对方竟是太子的门客。在亲情与江山之间，康熙陷入两难。最终，在一场科举舞弊大案中，康熙痛下决心严惩太子党羽，并首次向宜妃吐露了身为帝王的孤独。本季加重了朝堂权谋的戏份，情感更加深沉。
系列中政治权谋最为成熟的一部。虽然还是单元探案的形式，但主线贯穿始终，戏剧张力极强。张国立的表演把帝王的威严与父亲的无奈融合得天衣无缝。既有民间疾苦的接地气，又有皇家斗争的冷酷。
康熙第三次下江南，这次他不仅要查贪官，还要面对太子在朝中结党营私的棘手难题。
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